はい、含まれています。任意のブーリアン演算を行えますが、演算で変更した部分は再メッシュが必要です。
解析目的はユーザーによって異なるため、すべてのブーリアン操作に対応できるモデルを事前に用意することはできません。
ソーボーン社のモデルは不要な要素を排し、幅広い解析で安定して利用できるよう設計されています。